AT3G56120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.980 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function Met10 (InterPro:IPR003402); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Met-10+ like family protein (TAIR:AT4G27340.1); Has 1391 Blast hits to 1232 proteins in 427 species: Archae - 416; Bacteria - 202; Metazoa - 266; Fungi - 150; Plants - 114; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 243 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:20823243..20826357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52917.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 468 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFDESKFDVN LKLWALRIPR ELCKSASRIL NGYMLNMPRI KPITEDPTCE KTRLVILSES VKNADLSEIP EEKLNQLKKL SELEVVPHSV TLGYSYWSAD 101: HLLKQILPDG LDIPSSFETI GHIAHLNLHD ELLPFKDVIA KVIYDKNYPR IKTIVNKVGT ISNEFRVPKF EVLAGENGME TEVKQYGARF KLDYGLVYWN 201: SRLEHEHMRL SSLFKPGETV CDMFAGIGPF AIPAAQKGCF VYANDLNPDS VRYLKINAKF NKVDDLICVH NMDARKFFSH LMAVSTCEDN LQSVADNDKT 301: KEAAVSRGGE TNSSGEEIRE SNASINEPLG ANKKPSGTTK TENGVGKDCK SIEGHANKRL RQTLLPIAKP WEHIDHVIMN LPASALQFLD SFSNVIQKKY 401: WKGPLPLIHC YCFIRASETT EFIIAEAETA LKFHIEDPVF HKVRDVAPNK AMFCLSFRLP EACLKQEE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)