AT5G40530.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Methyltransferase-related (InterPro:IPR007823); Has 408 Blast hits to 408 proteins in 202 species: Archae - 3; Bacteria - 0; Metazoa - 110; Fungi - 140; Plants - 48; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 107 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:16234551..16236100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32762.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 287 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTTEENKTSR NRKRKRQRNP KPSKEEPIET TPKNQNEKKN QRDTKNQQHG GSSAPSKRPK PSNFLDALRE RLSGGQFRML NEKLYTCSGK EALDYFKEDP 101: QMFDMYHTGY QQQMSNWPEL PVNSIINWLL SNSSSLVVAD FGCGDARIAK SVKNKVFSFD LVSKNPSVIA CDMSNTSLES SSVDVAVFCL SLMGTNYSSY 201: IKEAHRVLRP SGMLLIAEVK SRFDPNNGGA DPKDFVKAVC DLGFTSVLKD FSNKMFILFH FKKKEQMNSN QKIIKWPELK ACLYKRR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)