AT3G48690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with carboxylesterase whose activity was tested using both pNA and 2,4-D-methyl. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CXE12; FUNCTIONS IN: carboxylesterase activity; INVOLVED IN: response to salt stress; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lipase, GDXG, active site (InterPro:IPR002168), Alpha/beta hydrolase fold-3 (InterPro:IPR013094); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: carboxyesterase 13 (TAIR:AT3G48700.1); Has 9324 Blast hits to 9298 proteins in 1467 species: Archae - 108; Bacteria - 5259; Metazoa - 789; Fungi - 845; Plants - 1410; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 910 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:18037186..18038160 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35569.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 324 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSEIAVDCS PLLKIYKSGR IERLMGEATV PPSSEPQNGV VSKDVVYSAD NNLSVRIYLP EKAAAETDSK LPLLVYFHGG GFIIETAFSP TYHTFLTTSV 101: SASNCVAVSV DYRRAPEHPI SVPFDDSWTA LKWVFTHITG SGQEDWLNKH ADFSRVFLSG DSAGANIVHH MAMRAAKEKL SPGLNDTGIS GIILLHPYFW 201: SKTPIDEKDT KDETLRMKIE AFWMMASPNS KDGTDDPLLN VVQSESVDLS GLGCGKVLVM VAEKDALVRQ GWGYAAKLEK SGWKGEVEVV ESEGEDHVFH 301: LLKPECDNAI EVMHKFSGFI KGGN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)