AT4G35000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 ASURE: peroxisome What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ascorbate peroxidase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a microsomal ascorbate peroxidase APX3. Ascorbate peroxidases are enzymes that scavenge hydrogen peroxide in plant cells. Eight types of APX have been described for Arabidopsis: three cytosolic (APX1, APX2, APX6), two chloroplastic types (stromal sAPX, thylakoid tAPX), and three microsomal (APX3, APX4, APX5) isoforms. The APX3 protein interacts with AKR2 (ankyrin-containing protein that interacts with AFT1) and AFT1, a 14-3-3 protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ascorbate peroxidase 3 (APX3); FUNCTIONS IN: L-ascorbate peroxidase activity; INVOLVED IN: response to oxidative stress; LOCATED IN: in 7 components; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem peroxidase (InterPro:IPR010255), Plant ascorbate peroxidase (InterPro:IPR002207), Peroxidases heam-ligand binding site (InterPro:IPR019793), Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial (InterPro:IPR002016), Peroxidase, active site (InterPro:IPR019794); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ascorbate peroxidase 5 (TAIR:AT4G35970.1); Has 9863 Blast hits to 8656 proteins in 1251 species: Archae - 86; Bacteria - 3261; Metazoa - 20; Fungi - 794; Plants - 3685; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2017 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:16665007..16667541 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31573.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 287 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAPIVDAEY LKEITKARRE LRSLIANKNC APIMLRLAWH DAGTYDAQSK TGGPNGSIRN EEEHTHGANS GLKIALDLCE GVKAKHPKIT YADLYQLAGV 101: VAVEVTGGPD IVFVPGRKDS NVCPKEGRLP DAKQGFQHLR DVFYRMGLSD KDIVALSGGH TLGRAHPERS GFDGPWTQEP LKFDNSYFVE LLKGESEGLL 201: KLPTDKTLLE DPEFRRLVEL YAKDEDAFFR DYAESHKKLS ELGFNPNSSA GKAVADSTIL AQSAFGVAVA AAVVAFGYFY EIRKRMK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)