AT5G62810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 ASURE: peroxisome What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : peroxin 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
mutant has a defect in the intracellular transport of thiolase from the cytosol to glyoxysomes (formerly known as ped2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
peroxin 14 (PEX14); FUNCTIONS IN: protein transporter activity, protein binding; INVOLVED IN: peroxisome organization, protein targeting to peroxisome; LOCATED IN: cytosol, peroxisome, plasma membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peroxisome membrane anchor protein Pex14p, N-terminal (InterPro:IPR006785); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein with RING/U-box and TRAF-like domains (TAIR:AT5G62800.1); Has 366 Blast hits to 354 proteins in 137 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 94; Fungi - 149; Plants - 89; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 32 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:25220323..25223571 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55597.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 507 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATHQQTQPP SDFPALADEN SQIPEATKPA NEVQQATIAQ DPPTSVFKNS EPIREDQIQN AIKFLSHPRV RGSPVIHRRS FLERKGLTKE EIDEAFRRVP 101: DPPPSSQTTV TTSQDGQQAV STVQPQAMQP VVAAPAPLIV TPQAAFLSRF RWYHAILAVG VLAASGAGTA VFIKRSLIPR FKSWVQRIML EEETDPLKKA 201: DAKPSLAEEA VAAAKAASAA ASDVARVSQE MMITKNEERK YFEDLTHLLG VQVQEMKSLS NNIRKLEGQS NNIPKIYSAD QEVYNGSVTT ARKPYTNGSN 301: VDYDTRSARS ASPPAAPADS SAPPHPKSYM DIMSMIQRGE KPSNIREIND MPPNPNQPLS DPRIAPKSKP WDYGQAPQDE SSNGQWWQQK NPRSTDFGYE 401: TTTAARFTAN QNETSTMEPA AFQRQRSWVP PQPPPVAMAE AVEAIRRPKP QAKIDQEAAA SDGQSGVSDE LQKITKFSES GGDGSGGIKI AEIQEETEQQ 501: HISQEGN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)