AT3G04080.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 ASURE: golgi What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : apyrase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an enzyme with ATPase and ADPase activity (an apyrase) that when mutated in combination with ATAPY2 causes a complete inhibition of pollen germination. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
apyrase 1 (APY1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleoside phosphatase GDA1/CD39 (InterPro:IPR000407); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: apyrase 2 (TAIR:AT5G18280.1); Has 1435 Blast hits to 1431 proteins in 229 species: Archae - 0; Bacteria - 35; Metazoa - 605; Fungi - 313; Plants - 348; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 134 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:1068068..1070917 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51196.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 471 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTAKRAIGRH ESLADKVHRH RGLLLVISIP IVLIALVLLL MPGTSTSVSV IEYTMKNHEG GSNSRGPKNY AVIFDAGSSG SRVHVYCFDQ NLDLVPLENE 101: LELFLQLKPG LSAYPNDPRQ SANSLVTLLD KAEASVPREL RPKTPVRVGA TAGLRALGHQ ASENILQAVR ELLKGRSRLK TEANAVTVLD GTQEGSYQWV 201: TINYLLRTLG KPYSDTVGVV DLGGGSVQMA YAIPEEDAAT APKPVEGEDS YVREMYLKGR KYFLYVHSYL HYGLLAARAE ILKVSEDSNN PCIATGYAGT 301: YKYGGKAFKA AASPSGASLD ECRRVAINAL KVNNSLCTHM KCTFGGVWNG GGGGGQKKMF VASFFFDRAA EAGFVDPNQP VAEVRPLDFE KAANKACNMR 401: MEEGKSKFPR VEEDNLPYLC LDLVYQYTLL VDGFGLKPSQ TITLVKKVKY GDYAVEAAWP LGSAIEAVSS P |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)