AT5G18280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : apyrase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an enzyme with ATPase and ADPase activity (an apyrase) that when mutated in combination with ATAPY1 causes a complete inhibition of pollen germination. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
apyrase 2 (APY2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleoside phosphatase GDA1/CD39 (InterPro:IPR000407); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: apyrase 1 (TAIR:AT3G04080.1); Has 1437 Blast hits to 1429 proteins in 222 species: Archae - 0; Bacteria - 35; Metazoa - 609; Fungi - 299; Plants - 361; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 133 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:6050799..6054875 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 62920.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 578 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLNIVGSYPS PAIVTHNVFC LHPSLSHTKF RSEAHTSFGF QIKSGDSSRF PKFTVDLEPL QDPPQTTASS GTGNGNGKIR YRSPSSTELL ESGNHSPTSD 101: SVDGGKMTAK RGIGRHESLA DKIQRHRGII LVISVPIVLI GLVLLLMPGR SISDSVVEEY SVHNRKGGPN SRGPKNYAVI FDAGSSGSRV HVYCFDQNLD 201: LIPLGNELEL FLQLKPGLSA YPTDPRQAAN SLVSLLDKAE ASVPRELRPK THVRVGATAG LRTLGHDASE NILQAVRELL RDRSMLKTEA NAVTVLDGTQ 301: EGSYQWVTIN YLLRNLGKPY SDTVGVVDLG GGSVQMAYAI SEEDAASAPK PLEGEDSYVR EMYLKGRKYF LYVHSYLHYG LLAARAEILK VSEDSENPCI 401: VAGYDGMYKY GGKEFKAPAS QSGASLDECR RITINALKVN DTLCTHMKCT FGGVWNGGRG GGQKNMFVAS FFFDRAAEAG FVDPKQPVAT VRPMDFEKAA 501: KKACSMKLEE GKSTFPLVEE ENLPYLCMDL VYQYTLLIDG FGLEPSQTIT LVKKVKYGDQ AVEAAWPLGS AIEAVSSP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)