AT2G37550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.788 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ARF-GAP domain 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
A member of ARF GAP domain (AGD), A thaliana has 15 members, grouped into four classes. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ARF-GAP domain 7 (AGD7); FUNCTIONS IN: ARF GTPase activator activity, DNA binding, zinc ion binding; INVOLVED IN: regulation of ARF GTPase activity; LOCATED IN: cytosol, nucleus; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Arf GTPase activating protein (InterPro:IPR001164); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ARF-GAP domain 6 (TAIR:AT3G53710.2); Has 3753 Blast hits to 3670 proteins in 253 species: Archae - 0; Bacteria - 30; Metazoa - 1888; Fungi - 664; Plants - 561; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15755544..15757456 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49254.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 456 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAARRLRTL QSQPENKVCV DCSQKNPQWA SISYGIFMCL ECSGKHRGLG VHISFVRSVT MDSWSEIQIK KMDAGGNERL NNFLAQYGIS KETDIISKYN 101: SNAASVYRDR IQALAEGRQW RDPPIVKESV GGGLMNKKPP LSQGGGRDSG NGGWDNWDND DSFRSTDMRR NQSAGDFRSS GGRGAPAKSK SSEDIYSRSQ 201: LEASAANKES FFAKRMAENE SKPEGLPPSQ GGKYVGFGSS PGPAPRSNQQ SGGGDVFSVM SEGFGRLSLV AASAANVVQT GTMEFTSKVK EGGLDQTVSE 301: TVNVVASKTT EIGQRTWGIM KGVMAIASQK VEEFTKEEAS TWNQQNKTEG NGYYQNSGIG NKTANSSFGG SQSSSSGHNN SYRNSNSWDD WGEENNSKKE 401: AAPKVSTSND DDDGGWAGWD DNDAKDDDFY YQPASDKKSV GHNGKSDTAW TGGGFL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)