AT1G01510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.936 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a homolog of human CtBP. Mutant has longer and thicker leaves than wild type. Involved in controlling polar cell expansion in the leaf width direction. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ANGUSTIFOLIA (AN); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding (InterPro:IPR006140), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein (TAIR:AT1G12550.1); Has 20556 Blast hits to 20427 proteins in 2617 species: Archae - 372; Bacteria - 13694; Metazoa - 624; Fungi - 929; Plants - 529; Viruses - 5; Other Eukaryotes - 4403 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:187235..189836 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 70153.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 636 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSKIRSSATM PHRDQPSPAS PHVVTLNCIE DCALEQDSLA GVAGVEYVPL SRIADGKIES ATAVLLHSLA YLPRAAQRRL RPHQLILCLG SADRAVDSTL 101: AADLGLRLVH VDTSRAEEIA DTVMALILGL LRRTHLLSRH ALSASGWLGS LQPLCRGMRR CRGMVLGIVG RSVSARYLAS RSLAFKMSVL YFDVPEGDEE 201: RIRPSRFPRA ARRMDTLNDL LAASDVISLH CALTNDTVQI LNAECLQHIK PGAFLVNTGS CQLLDDCAVK QLLIDGTIAG CALDGAEGPQ WMEAWVKEMP 301: NVLILPRSAD YSEEVWMEIR EKAISILHSF FLDGVIPSNT VSDEEVEESE ASEEEEQSPS KHEKLAIVES TSRQQGESTL TSTEIVRREA SELKESLSPG 401: QQHVSQNTAV KPEGRRSRSG KKAKKRHSQQ KYMQKTDGSS GLNEESTSRR DDIAMSDTEE VLSSSSRCAS PEDSRSRKTP LEVMQESSPN QLVMSSKKFI 501: GKSSELLKDG YVVALYAKDL SGLHVSRQRT KNGGWFLDTL SNVSKRDPAA QFIIAYRNKD TVGLRSFAAG GKLLQINRRM EFVFASHSFD VWESWSLEGS 601: LDECRLVNCR NSSAVLDVRV EILAMVGDDG ITRWID |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)