AT5G66930.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.901 What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
unknown protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF1649 (InterPro:IPR012445); Has 236 Blast hits to 236 proteins in 105 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 93; Fungi - 70; Plants - 56; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 17 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:26725997..26727127 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18663.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 157 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNCEVCQLKE LEVESFEIRE VLRCILHTIV FHRALGLIRP KDIDLELFEI TYVQCGEIEV EKKIDEKIEQ FINWIEKHPN KKSQICLSFY EVKSKQPSWF 101: TKIERLYWEQ WYINLNVLQP TKPPVGKSHH SKLVMDPGGS IDQFPVLISK NYIFLLL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)