AT5G65630.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : global transcription factor group E7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
This gene is predicted to encode a bromodomain-containing protein. Plant lines expressing RNAi constructs targeted against GTE7 show some resistance to agrobacterium-mediated root transformation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
global transcription factor group E7 (GTE7); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Bromodomain (InterPro:IPR001487); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: global transcription factor group E2 (TAIR:AT5G10550.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:26226311..26228257 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 65080.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 590 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPAVFATLN EPSYQEQCGA VFMRKFTNQS VTENTNNLPL FNPNPNPNFE RSNSSKQCDD SSEFGSYATF NLAGYTSSQL RELKKRFTSE LKQIRILRER 101: IESGTFETQQ GYTIPEVPAV RSAPLNNFTG EKNDLGPKKK KQKKNVSGLK RSNQFGPSDP ESEKLLAGML NTCSQILVKL MKHKWAWVFN TPVDVVGLGL 201: HDYHQVVKKP MDLGTVKLNL DKGFYVSPID FATDVRLTFD NAMTYNPKGQ DVYFMADKLL DHFDGMFNPA FKKFEAQQLK LTGSSSRPEP DFKPDFKQRQ 301: WNQNPPMVAN PRKGTEQISI AKKLDSVKPP QPTLPPQLVE PSRVQSPSPP PPPPVIQPEL PQPQPPPPQL EIEVEAPPDV SEVSKGRKGK LPKPKAKDPN 401: KRLMTMEEKS KLGMNLQDLP PEKLGQLLQI LRKRNGHLAQ DGDEIELDIE AVDNETLWEL DRFVTNYKKM ASKIKRQGFI RNVSTPPRNM ASVAEMGSAE 501: KRTRRGDAGE EDVDIGEDIP IEDYPSVEIE RDGTAVAAAA SSGSSSSGSS SSSGGSSSSS DSGSGGSSSG SDSDADSVQS PFVEAKEAQC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)