AT5G61640.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.715 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : peptidemethionine sulfoxide reductase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
ubiquitous enzyme that repairs oxidatively damaged proteins | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
peptidemethionine sulfoxide reductase 1 (PMSR1); FUNCTIONS IN: peptide-methionine-(S)-S-oxide reductase activity, oxidoreductase activity, acting on sulfur group of donors, disulfide as acceptor; INVOLVED IN: response to oxidative stress, protein modification process; LOCATED IN: cytosol; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptide methionine sulphoxide reductase MsrA (InterPro:IPR002569); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: peptidemethionine sulfoxide reductase 3 (TAIR:AT5G07470.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:24775107..24776147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22899.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 202 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNILNKLGIG SSRQTNMDPS PIAQVIDDEA PAPGNQFTQF GAGCFWSVEL AYQRVPGVTQ TEVGYSQGIT HDPSYKDVCS GTTNHAEIVR VQYDPKECSY 101: QSLLDLFWSK HDPTTLNRQG NDVGTQYRSG IYFYNPEQEK LARESLERHQ QQVDRKVVTE ILPAKKFYRA EEHHQQYLSK GGRFGLKQST EKGCNDPIRC 201: YG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)