AT5G52100.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Dihydrodipicolinate reductase, bacterial/plant | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Is essential for chloroplast NAD(P)H dehydrogenase activity, which is involved in electron transfer between PSII and PSI. Likely functions in biogenesis or stabilization of the NAD(P)H dehydrogenase complex. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
chlororespiration reduction 1 (crr1); FUNCTIONS IN: dihydrodipicolinate reductase activity; INVOLVED IN: photosynthesis, light reaction, lysine biosynthetic process via diaminopimelate; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dihydrodipicolinate reductase, C-terminal (InterPro:IPR022663), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Dihydrodipicolinate reductase, bacterial/plant (InterPro:IPR011770), Dihydrodipicolinate reductase, N-terminal (InterPro:IPR000846); Has 2708 Blast hits to 2708 proteins in 1059 species: Archae - 78; Bacteria - 2168; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 45; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 417 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:21170203..21172107 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32039.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 298 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAVNCHFFQ LSRHLKPSRP SFSCSASQPS QNNIKVIING AAKEIGRAAV VAVTKARGME LAGAVDNHFV GEDIGLLCDM EEPLEIPVVS DLTMVLGSIS 101: QGKEVGVVID FTDPSTVYEN VKQATAFGMK SVVYVPRIKP ETVSALSALC DKATMGCLVA PTLSIGSILL QQAVIMASFH YNNVELVESR PNAADLPSPE 201: AIQIANNISN LGQIYNREDS STDVQARGQV IGEDGVRVHS MVLPGLPSST QVYFSSPGDV YTVKHDIIDV RSLMPGLLLA IRKVVRLKNL VYGLEKFL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)