AT5G41990.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.516 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : with no lysine (K) kinase 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the WNK family (9 members in all) of protein kinases, the structural design of which is clearly distinct from those of other known protein kinases, such as receptor-like kinases and mitogen-activated protein kinases. Interacts specifically with and phosphorylates AtVHA-C, subunit C of the vacuolar H+-ATPase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
with no lysine (K) kinase 8 (WNK8); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: with no lysine (K) kinase 10 (TAIR:AT1G64630.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:16795085..16797562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63806.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 563 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASGSGFLGQ ISSMEEADFA EKDPSGRYIR YDDVLGRGAF KTVYKAFDEV DGIEVAWNLV SIEDVMQMPG QLERLYSEVH LLKALKHENI IKLFYSWVDE 101: KNKTINMITE LFTSGSLRVY RKKHRKVDPK AIKNWARQIL KGLNYLHSQN PPVIHRDLKC DNIFVNGNTG EVKIGDLGLA TVLQQPTARS VIGTPEFMAP 201: ELYEEEYNEL VDIYSFGMCM LEMVTCEYPY NECRNQAQIY KKVTSNIKPQ SLGKVDDPQV RQFIEKCLLP ASSRPTALEL SKDPFLARDG GKDSALLASS 301: STSSKYVRPP QLEHLPMDVD HNENKSVSSN EDYPWSQTIE LQRIAENKEF RLRGERSDDV TASMVLRIAD PSGKCRIVHF AFYLESDTAT AIAEEMVEEL 401: HLTSQEVVVI ADMIDDFIMQ LLSDRTSSHH NQNSPRLTHE DHEAANQQTV NSKDEEAAGQ SMKSDISADY YFPYSANDGN AAMEAGRDAE SMSSYLDSCS 501: MMSTIYNLSI SDNDYPEDLK TELNLIESQF NQSFQDLLKL KEDAIENAKR KWITKKQKAV NIS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)