AT5G27450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : mevalonate kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with mevalonate kinase activity involved in the mevalonate pathway. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
mevalonate kinase (MK); FUNCTIONS IN: mevalonate kinase activity; INVOLVED IN: isoprenoid biosynthetic process, metabolic process, phosphorylation; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: 30 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mevalonate kinase (InterPro:IPR006205), GHMP kinase, ATP-binding, conserved site (InterPro:IPR006203), Mevalonate/galactokinase (InterPro:IPR006206), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold (InterPro:IPR020568), GHMP kinase (InterPro:IPR006204), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup (InterPro:IPR014721), GHMP kinase, C-terminal (InterPro:IPR013750); Has 2155 Blast hits to 2126 proteins in 899 species: Archae - 214; Bacteria - 1320; Metazoa - 166; Fungi - 147; Plants - 62; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 246 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:9691051..9692975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40646.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 378 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEVKARAPGK IILAGEHAVV HGSTAVAAAI DLYTYVTLRF PLPSAENNDR LTLQLKDISL EFSWSLARIK EAIPYDSSTL CRSTPASCSE ETLKSIAVLV 101: EEQNLPKEKM WLSSGISTFL WLYTRIIGFN PATVVINSEL PYGSGLGSSA ALCVALTAAL LASSISEKTR GNGWSSLDET NLELLNKWAF EGEKIIHGKP 201: SGIDNTVSAY GNMIKFCSGE ITRLQSNMPL RMLITNTRVG RNTKALVSGV SQRAVRHPDA MKSVFNAVDS ISKELAAIIQ SKDETSVTEK EERIKELMEM 301: NQGLLLSMGV SHSSIEAVIL TTVKHKLVSK LTGAGGGGCV LTLLPTGTVV DKVVEELESS GFQCFTALIG GNGAQICY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)