AT5G21100.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Plant L-ascorbate oxidase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Plant L-ascorbate oxidase; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, copper ion binding, L-ascorbate oxidase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Multicopper oxidase, type 3 (InterPro:IPR011707), Multicopper oxidase, type 2 (InterPro:IPR011706), Cupredoxin (InterPro:IPR008972), Multicopper oxidase, copper-binding site (InterPro:IPR002355), Multicopper oxidase, type 1 (InterPro:IPR001117), L-ascorbate oxidase, plants (InterPro:IPR017760); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Plant L-ascorbate oxidase (TAIR:AT5G21105.1); Has 9868 Blast hits to 8872 proteins in 1572 species: Archae - 64; Bacteria - 4270; Metazoa - 566; Fungi - 3292; Plants - 1286; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 390 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:7168312..7170719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64269.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 573 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVIVWWLLT VVVVAFHSAS AAVVESTWEV EYKYWWPDCK EGIVMAINGQ FPGPTIDAVA GDTVIIHVVN KLSTEGVVIH WHGIRQKGTP WADGAAGVTQ 101: CPINPGETFT YKFIVDKAGT HFYHGHYGMQ RSSGLYGMLI VRSPKERLIY DGEFNLLLSD WWHQSIHAQE LALSSRPMRW IGEPQSLLIN GRGQFNCSQA 201: AYFNKGGEKD VCTFKENDQC APQTLRVEPN RVYRLRIAST TALASLNLAV QGHQLVVVEA DGNYVAPFTV NDIDVYSGET YSVLLKTNAL PSKKYWISVG 301: VRGREPKTPQ ALTVINYVDA TESRPSHPPP VTPIWNDTDR SKSFSKKIFA AKGYPKPPEK SHDQLILLNT QNLYEDYTKW SINNVSLSVP VTPYLGSIRY 401: GLKSAYDLKS PAKKLIMDNY DIMKPPPNPN TTKGSGIYNF AFGIVVDVIL QNANVLKGVI SEIHPWHIHG HDFWVLGYGE GKFKPGIDEK TFNLKNPPLR 501: NTVVLYPFGW TAIRFVTDNP GVWFFHCHIE PHLHMGMGVV FVEGVDRIGK MEIPDEALGC GLTRKWLMNR GRP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)