AT5G19630.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.996 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
alpha/beta-Hydrolases superfamily protein; Has 1062 Blast hits to 1062 proteins in 417 species: Archae - 16; Bacteria - 763; Metazoa - 1; Fungi - 28; Plants - 66; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 188 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:6628147..6629937 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24491.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 228 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSNFIVESC SVDSEEGVKL HTRIFKPRNE GEEVSDDENL VIVLVHPFSL LGGCQALLKG IASELASKGF KSVTFDTRGA GKSTGRATLT GFAEVKDVVA 101: VCRWLCQNVD AHRILLVGSS AGAPIAGSAV EQVEQVVGYV SLGYPFGLMA SILFGRHHKA ILSSPKPKLF VMGTQDGFTS VSQLKKKLKS AVGRTETHLI 201: EGVSHFQMEG PEYDSQVTDI ICKFISSL |
||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)