AT5G19450.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : calcium-dependent protein kinase 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
calcium-dependent protein kinase (CDPK19) mRNA, complete | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
calcium-dependent protein kinase 19 (CDPK19); FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), EF-hand (InterPro:IPR018248), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Calcium-dependent protein kinase (InterPro:IPR020642), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calmodulin-domain protein kinase 7 (TAIR:AT5G12480.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr5:-:6558672..6561471 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 59943.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 6.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 533 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGNCCASPGS ETGSKKGKPK IKSNPFYSEA YTTNGSGTGF KLSVLKDPTG HDISLMYDLG REVGRGEFGI TYLCTDIKTG EKYACKSISK KKLRTAVDIE 101: DVRREVEIMK HMPRHPNIVS LKDAFEDDDA VHIVMELCEG GELFDRIVAR GHYTERAAAA VMKTILEVVQ ICHKHGVMHR DLKPENFLFA NKKETSALKA 201: IDFGLSVFFK PGEGFNEIVG SPYYMAPEVL RRNYGPEVDI WSAGVILYIL LCGVPPFWAE TEQGVAQAII RSVIDFKRDP WPRVSETAKD LVRKMLEPDP 301: KKRLSAAQVL EHSWIQNAKK APNVSLGETV KARLKQFSVM NKLKKRALRV IAEHLSVEEV AGIKEAFEMM DSKKTGKINL EELKFGLHKL GQQQIPDTDL 401: QILMEAADVD GDGTLNYGEF VAVSVHLKKM ANDEHLHKAF SFFDQNQSDY IEIEELREAL NDEVDTNSEE VVAAIMQDVD TDKDGRISYE EFAAMMKAGT 501: DWRKASRQYS RERFNSLSLK LMREGSLQLE GEN |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)