AT5G10470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : kinesin like protein for actin based chloroplast movement 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Kinesin that binds cyclin-dependent kinase CDKA;1 as homodimer or as heterodimer with KCA2. Demarcates the division site in plant cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
kinesin like protein for actin based chloroplast movement 1 (KAC1); FUNCTIONS IN: microtubule binding, protein binding, microtubule motor activity; INVOLVED IN: preprophase band assembly, chloroplast avoidance movement, chloroplast accumulation movement, cytokinesis; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Kinesin, motor region, conserved site (InterPro:IPR019821), Kinesin, motor domain (InterPro:IPR001752); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: kinesin like protein for actin based chloroplast movement 2 (TAIR:AT5G65460.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:3290121..3297248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 141044.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1273 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MADQRSKTNR WNWEVSGFEP RKSSSNASFA ESTGHRTTGP LLRRNSISTP SLPPKQAIAS KVNGLKEKVK LAKEDYLELR QEATDLQEYS NAKLDRVTRY 0101: LGVLAEKSRK LDQFVLETEA RISPLINEKK RLFNDLLTAK GNIKVFCRAR PLFEDEGPSV IEFPGDCTIC VNTSDDTLSN PKKDFEFDRV YGPHVGQAAL 0201: FSDVQPFVQS ALDGSNVSIL SYGQTNAGKT YTMEGSNHDR GLYARCFEEL FDLANSDSTS TSRFSFSLSV FEIYNEQIRD LLSETQSNLP NINMDLHESV 0301: IELGQEKVDN PLEFLGVLKS AFLNRGNYKS KFNVTHLIVS IHIYYSNTIT GENIYSKLSL VDLAGSEGLI MENDSGDHVT DLLHVMNSIS ALGDVLSSLT 0401: SGKDSIPYDN SILTRVLADS LGGSSKTLMI VNICPSVQTL SETISCLNYA ARARNTVPSL GNRDTIKKWR DVASDARKEL LEKERENQNL KQEVVGLKKA 0501: LKDANDQCVL LYSEVQRAWK VSFTLQSDLK SENIMLVDKH RLEKEQNSQL RNQIAQFLQL DQEQKLQMQQ QDSAIQNLQA KITDLESQVS EAVRSDTTRT 0601: GDALQSQDIF SPIPKAVEGT TDSSSVTKKL EEELKKRDAL IERLHEENEK LFDRLTERSM AVSTQVLSPS LRASPNIQPA NVNRGEGYSA EAVALPSTPN 0701: KNNGAITLVK SGTDLVKTTP AGEYLTAALN DFDPEEYEGL AAIADGANKL LMLVLAAVIK AGASREHEIL AEIRDSVFSF IRKMEPRRVM DTMLVSRVRI 0801: LYIRSLLARS PELQTIRVSP VECFLEKPNT GRSKSTSRGS SPGRSPVRYL DTQIHGFKVN IKAERRNKLA SVVSRMRGLE QDAGRQQVTG VKLREMQDEA 0901: KSFAIGNKAL AALFVHTPAG ELQRQIRLWL AENFEFLSVT SDDVSGGNGG QLELLSTAIM DGWMAGLGAA VPPHTDALGQ LLSEYAKRVY TSQMQHMKDI 1001: AGTLAAEEAE DAGQVSKLRS ALESVDHKRR KILQQMKSDA ALLNLEEGSS PIPNPSTAAE DSRLASLISL DGILKQVKEI TRQASVHVLS KSKKKALLES 1101: LDELTERMPS LLDIDHPCAQ REIATAHQLV ETIPEQEDTN ILEQSHDRRP SLESISSGET DVSQWNVLQF NTGSSAPFII KCGGNNNSEL VIKADARVQE 1201: PKGGEIVRVV PRPSVLVNMS LEEMKQMFVQ LPEALSLLAL ARTADGTRAR YSRLYKTLAM KVPSLKDLVS ELE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)