AT5G10330.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : histidinol phosphate aminotransferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes histidinol-phosphate aminotransferase that catalyzes the eighth step in histidine biosynthesis. Loss of function mutations are embryo lethal. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
histidinol phosphate aminotransferase 1 (HPA1); FUNCTIONS IN: histidinol-phosphate transaminase activity; INVOLVED IN: histidine biosynthetic process, embryo development ending in seed dormancy; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: stem, fruit, root, flower; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aminotransferase, class I/classII (InterPro:IPR004839), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Histidinol-phosphate aminotransferase (InterPro:IPR005861), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2 (InterPro:IPR015422), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HISTIDINE BIOSYNTHESIS 6B (TAIR:AT1G71920.2); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:3248027..3249858 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46637.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 417 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGVINVQGSP SFSIHSSESN LRKSRALKKP FCSIRNRVYC AQSSSAAVDE SKNITMGDSF IRPHLRQLAA YQPILPFEVL SAQLGRKPED IVKLDANENP 101: YGPPPEVFEA LGNMKFPYVY PDPQSRRLRD ALAQDSGLES EYILVGCGAD ELIDLIMRCV LDPGEKIIDC PPTFSMYVFD AAVNGAGVIK VPRNPDFSLN 201: VDRIAEVVEL EKPKCIFLTS PNNPDGSIIS EDDLLKILEM PILVVLDEAY IEFSGVESRM KWVKKYENLI VLRTFSKRAG LAGLRVGYGA FPLSIIEYLW 301: RAKQPYNVSV AGEVAALAAL SNGKYLEDVR DALVRERERL FGLLKEVPFL NPYPSYSNFI LCEVTSGMDA KKLKEDLAKM GVMVRHYNSQ ELKGYVRVSA 401: GKPEHTDVLM ECLKQFY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)