AT5G10180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.716 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : slufate transporter 2;1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a low-affinity sulfate transporter expressed in the root cap and central cylinder, where it is induced by sulfur starvation. Expression in the shoot vascular system is not induced by sulfur starvation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
slufate transporter 2;1 (SULTR2;1); FUNCTIONS IN: sulfate transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: sulfate transport; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulphate transporter (InterPro:IPR011547), Sulphate transporter/antisigma-factor antagonist STAS (InterPro:IPR002645), Sulphate anion transporter, conserved site (InterPro:IPR018045), Sulphate anion transporter (InterPro:IPR001902); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: STAS domain / Sulfate transporter family (TAIR:AT1G77990.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:3193225..3196818 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74072.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 677 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKERDSESFE SLSHQVLPNT SNSTHMIQMA MANSGSSAAA QAGQDQPDRS KWLLDCPEPP SPWHELKRQV KGSFLTKAKK FKSLQKQPFP KQILSVLQAI 101: FPIFGWCRNY KLTMFKNDLM AGLTLASLCI PQSIGYATLA KLDPQYGLYT SVVPPLIYAL MGTSREIAIG PVAVVSLLIS SMLQKLIDPE TDPLGYKKLV 201: LTTTFFAGIF QASFGLFRLG FLVDFLSHAA IVGFMGGAAI VIGLQQLKGL LGITNFTTNT DIVSVLRAVW RSCQQQWSPH TFILGCSFLS FILITRFIGK 301: KYKKLFWLPA IAPLIAVVVS TLMVFLTKAD EHGVKTVRHI KGGLNPMSIQ DLDFNTPHLG QIAKIGLIIA IVALTEAIAV GRSFAGIKGY RLDGNKEMVA 401: IGFMNVLGSF TSCYAATGSF SRTAVNFAAG CETAMSNIVM AVTVFVALEC LTRLLYYTPI AILASIILSA LPGLININEA IHIWKVDKFD FLALIGAFFG 501: VLFASVEIGL LVAVVISFAK IILISIRPGI ETLGRMPGTD TFTDTNQYPM TVKTPGVLIF RVKSALLCFA NASSIEERIM GWVDEEEEEE NTKSNAKRKI 601: LFVVLDMSSL INVDTSGITA LLELHNKLIK TGVELVIVNP KWQVIHKLNQ AKFVDRIGGK VYLTIGEALD ACFGLKV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)