AT3G19710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : branched-chain aminotransferase4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Belongs to the branched-chain amino acid aminotransferase gene family. Encodes a methionine-oxo-acid transaminase. Involved in the methionine chain elongation pathway that leads to the ultimate biosynthesis of methionine-derived glucosinolates. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
branched-chain aminotransferase4 (BCAT4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aminotransferase, class IV (InterPro:IPR001544), Branched-chain amino acid aminotransferase II (InterPro:IPR005786); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes superfamily protein (TAIR:AT1G50110.1); Has 11097 Blast hits to 11097 proteins in 2502 species: Archae - 154; Bacteria - 6834; Metazoa - 263; Fungi - 399; Plants - 250; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3197 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:6847202..6849429 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39020.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 354 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPSAQPLPV SVSDEKYANV KWEELAFKFV RTDYMYVAKC NHGESFQEGK ILPFADLQLN PCAAVLQYGQ GLYEGLKAYR TEDGRILLFR PDQNGLRLQA 101: GADRLYMPYP SVDQFVSAIK QVALANKKWI PPPGKGTLYI RPILFGSGPI LGSFPIPETT FTAFACPVGR YHKDNSGLNL KIEDQFRRAF PSGTGGVKSI 201: TNYCPVWIPL AEAKKQGFSD ILFLDAATGK NIEELFAANV FMLKGNVVST PTIAGTILPG VTRNCVMELC RDFGYQVEER TIPLVDFLDA DEAFCTGTAS 301: IVTSIASVTF KDKKTGFKTG EETLAAKLYE TLSDIQTGRV EDTKGWTVEI DRQG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)