AT1G65860.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.841 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : flavin-monooxygenase glucosinolate S-oxygenase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
belongs to the flavin-monooxygenase (FMO) family, encodes a glucosinolate S-oxygenase that catalyzes the conversion of methylthioalkyl glucosinolates to methylsulfinylalkyl glucosinolates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
flavin-monooxygenase glucosinolate S-oxygenase 1 (FMO GS-OX1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Flavin-containing monooxygenase FMO (InterPro:IPR000960), Flavin-containing monooxygenase-like (InterPro:IPR020946); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: flavin-monooxygenase glucosinolate S-oxygenase 2 (TAIR:AT1G62540.1); Has 13357 Blast hits to 12951 proteins in 1760 species: Archae - 39; Bacteria - 7207; Metazoa - 1086; Fungi - 1434; Plants - 770; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2821 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:24499210..24502678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52312.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 459 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPTQNTICS KHVAVIGAGA AGLVTARELR REGHTVVVFD REKQVGGLWN YSSKADSDPL SLDTTRTIVH TSIYESLRTN LPRECMGFTD FPFVPRIHDI 101: SRDSRRYPSH REVLAYLQDF AREFKIEEMV RFETEVVCVE PVNGKWSVRS KNSVGFAAHE IFDAVVVCSG HFTEPNVAHI PGIKSWPGKQ IHSHNYRVPG 201: PFNNEVVVVI GNYASGADIS RDIAKVAKEV HIASRASESD TYQKLPVPQN NLWVHSEIDF AHQDGSILFK NGKVVYADTI VHCTGYKYYF PFLETNGYIN 301: INENRVEPLY KHVFLPALAP SLSFIGLPGM AIQFVMFEIQ SKWVAAVLSG RVILPSQDKM MEDIIEWYAT LDVLGIPKRH THKLGKISCE YLNWIAEECH 401: CSPVENWRIQ EVERGFQRMV SHPEIYRDEW DDDDLMEEAY KDFARKKLIS SHPSYFLES |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)