AT1G62560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.861 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : flavin-monooxygenase glucosinolate S-oxygenase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
belongs to the flavin-monooxygenase (FMO) family, encodes a glucosinolate S-oxygenase that catalyzes the conversion of methylthioalkyl glucosinolates to methylsulfinylalkyl glucosinolates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
flavin-monooxygenase glucosinolate S-oxygenase 3 (FMO GS-OX3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Flavin-containing monooxygenase FMO (InterPro:IPR000960), Flavin-containing monooxygenase-like (InterPro:IPR020946); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: flavin-monooxygenase glucosinolate S-oxygenase 2 (TAIR:AT1G62540.1); Has 15604 Blast hits to 15117 proteins in 1989 species: Archae - 85; Bacteria - 8709; Metazoa - 1148; Fungi - 1456; Plants - 809; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3397 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:23159912..23162551 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52691.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 462 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPAQNQITS KHVAVIGAGP AGLITSRELR REGHSVVVFE REKQVGGLWV YTPKSDSDPL SLDPTRSKVH SSIYESLRTN VPRESMGVRD FPFLPRFDDE 101: SRDARRYPNH REVLAYIQDF AREFKIEEMI RFETEVVRVE PVDNGNWRVQ SKNSGGFLED EIYDAVVVCN GHYTEPNIAH IPGIKSWPGK QIHSHNYRVP 201: DPFENEVVVV IGNFASGADI SRDIAKVAKE VHIASRAREP HTYEKISVPQ NNLWMHSEID TTHEDGSIVF KNGKVIFADS IVYCTGYKYN FPFLETNGYL 301: RIDEKRVEPL YKHVFPPALA PGLAFVGLPA MGIVFVMFEI QSKWVAAVLS GRVTLPSTDK MMEDINAWYA SLDALGIPKR HTHTIGRIQS EYLNWVAKES 401: GCELVERWRG QEVDGGYLRL VAHPETYRDE WDDDELIEEA YNDFSRKKLI SVDPSYYLEN GR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)