AT4G39940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : APS-kinase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
adenosine-5'-phosphosulfate-kinase (akn2) mRNA, complete | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
APS-kinase 2 (AKN2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adenylylsulphate kinase, C-terminal (InterPro:IPR002891); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: APS kinase (TAIR:AT2G14750.1); Has 4962 Blast hits to 4962 proteins in 1492 species: Archae - 54; Bacteria - 3008; Metazoa - 246; Fungi - 282; Plants - 130; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1242 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:18519787..18521276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31979.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 293 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEGLAIRASR PSVFCSIPGL GGDSHRKPPS DGFLKLPASS IPADSRKLVA NSTSFHPISA VNVSAQASLT ADFPALSETI LKEGRNNGKE KAENIVWHES 101: SICRCDRQQL LQQKGCVVWI TGLSGSGKST VACALSKALF ERGKLTYTLD GDNVRHGLNR DLTFKAEHRT ENIRRIGEVA KLFADVGVIC IASLISPYRR 201: DRDACRSLLP DGDFVEVFMD VPLHVCESRD PKGLYKLARA GKIKGFTGID DPYEAPVNCE VVLKHTGDDE SCSPRQMAEN IISYLQNKGY LEG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)