AT2G14750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : APS kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes adenosine-5'-phosphosulfate kinase. Provides activated sulfate for sulfation of secondary metabolites, including the glucosinolates. Essential for pollen viability. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
APS kinase (APK); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adenylylsulphate kinase, C-terminal (InterPro:IPR002891); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: APS-kinase 2 (TAIR:AT4G39940.1); Has 5042 Blast hits to 5042 proteins in 1485 species: Archae - 54; Bacteria - 2991; Metazoa - 244; Fungi - 284; Plants - 130; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1337 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:6314128..6315501 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29788.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 276 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIAAGAKSLL GLSMASPKGI FDSNSMSNSR SVVVVRACVS MDGSQTLSHN KNGSIPEVKS INGHTGQKQG PLSTVGNSTN IKWHECSVEK VDRQRLLDQK 101: GCVIWVTGLS GSGKSTLACA LNQMLYQKGK LCYILDGDNV RHGLNRDLSF KAEDRAENIR RVGEVAKLFA DAGIICIASL ISPYRTDRDA CRSLLPEGDF 201: VEVFMDVPLS VCEARDPKGL YKLARAGKIK GFTGIDDPYE PPLNCEISLG REGGTSPIEM AEKVVGYLDN KGYLQA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)