AT4G39950.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.940 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 79, subfamily B, polypeptide 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Belongs to cytochrome P450 and is involved in tryptophan metabolism. Converts Trp to indo-3-acetaldoxime (IAOx), a precursor to IAA and indole glucosinolates. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 79, subfamily B, polypeptide 2 (CYP79B2); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: in 8 processes; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 79, subfamily B, polypeptide 3 (TAIR:AT2G22330.1); Has 28507 Blast hits to 28366 proteins in 1550 species: Archae - 44; Bacteria - 2565; Metazoa - 10705; Fungi - 5395; Plants - 8898; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 900 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:18525311..18527284 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61351.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 541 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNTFTSNSSD LTTTATETSS FSTLYLLSTL QAFVAITLVM LLKKLMTDPN KKKPYLPPGP TGWPIIGMIP TMLKSRPVFR WLHSIMKQLN TEIACVKLGN 101: THVITVTCPK IAREILKQQD ALFASRPLTY AQKILSNGYK TCVITPFGDQ FKKMRKVVMT ELVCPARHRW LHQKRSEEND HLTAWVYNMV KNSGSVDFRF 201: MTRHYCGNAI KKLMFGTRTF SKNTAPDGGP TVEDVEHMEA MFEALGFTFA FCISDYLPML TGLDLNGHEK IMRESSAIMD KYHDPIIDER IKMWREGKRT 301: QIEDFLDIFI SIKDEQGNPL LTADEIKPTI KELVMAAPDN PSNAVEWAMA EMVNKPEILR KAMEEIDRVV GKERLVQESD IPKLNYVKAI LREAFRLHPV 401: AAFNLPHVAL SDTTVAGYHI PKGSQVLLSR YGLGRNPKVW ADPLCFKPER HLNECSEVTL TENDLRFISF STGKRGCAAP ALGTALTTMM LARLLQGFTW 501: KLPENETRVE LMESSHDMFL AKPLVMVGDL RLPEHLYPTV K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)