AT4G38570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.429 endoplasmic reticulum 0.313 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : probable CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
probable CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase 2 (PIS2); FUNCTIONS IN: phosphotransferase activity, for other substituted phosphate groups; INVOLVED IN: phosphatidylinositol biosynthetic process; LOCATED IN: endomembrane system, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: CDP-alcohol phosphatidyltransferase (InterPro:IPR000462), CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase, eukaryote (InterPro:IPR014387); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphatidylinositol synthase 1 (TAIR:AT1G68000.1); Has 2530 Blast hits to 2530 proteins in 950 species: Archae - 14; Bacteria - 1497; Metazoa - 167; Fungi - 185; Plants - 77; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 590 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:18031420..18033091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25581.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 225 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKQRPATLS VYLYIPNIVG YMRVLLNCIA FSVCFSNKTL FSLLYFFSFC CDAVDGWCAR KFNQVSTFGA VLDMVTDRVS TACLLVILSQ IYRPSLVFLS 101: LLALDIASHW LQMYSTFLSG KTSHKDVKDS TSWLFRLYYG NRMFMGYCCV SCEVLYIILL LIATNQTENL MNVVVKSLMQ ISPLSLLLAL SIFGWSIKQI 201: INVIQMKTAA DVCVLYDIEK QHKKP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)