AT4G34730.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ribosome-binding factor A family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ribosome-binding factor A family protein; FUNCTIONS IN: RNA binding; INVOLVED IN: rRNA processing; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosome-binding factor A, conserved site (InterPro:IPR020053), K homology-like, alpha/beta (InterPro:IPR015946), Ribosome-binding factor A (InterPro:IPR000238); Has 4827 Blast hits to 4826 proteins in 1979 species: Archae - 0; Bacteria - 4129; Metazoa - 5; Fungi - 0; Plants - 41; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 652 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:16570019..16571274 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24290.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 215 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPNLLHTNQS HFFFLHHPPI YTVSSKTQAF HFPQSMAPVN LRTNLSVRRT VRCMANPRRV KMVAKQIMRE LSDMLLTDTV LQHAVLPEAA LGADRYLSSL 101: TTISDVEVSN DLQVVKVYVS VFGDDRGKDV AIAGLKSKAK YVRSELGKRM KLRLTPEVRF IEDEAMERGS RVIAILDKIK AEKGSGEGKT EPSDSTEDDQ 201: DWEVDDPDED IIYVK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)