AT4G29210.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : gamma-glutamyl transpeptidase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
The gene encodes a gamma-glutamyltransferase (AKA gamma-glutamyl transpeptidase, EC 2.3.2.2) that is located in the vacuole and is most active in roots. The encoded enzyme is involved in the initial degradation of glutathione conjugates in this cell compartment. It is also induced by xenobiotics and contributes to xenobiotics metabolism. Note that conflicting nomenclature exists in the literature: At4g29210 is named as GGT3 in Plant J. 2007 Mar 49(5):878-88; At4g29210 is named as GGT4 and At1g69820 as GGT3 in Plant Physiol. 2007 Aug 144(4):1715-32. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
gamma-glutamyl transpeptidase 4 (GGT4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Gamma-glutamyltranspeptidase (InterPro:IPR000101); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: gamma-glutamyl transpeptidase 1 (TAIR:AT4G39640.2); Has 9173 Blast hits to 9142 proteins in 1473 species: Archae - 86; Bacteria - 4214; Metazoa - 707; Fungi - 305; Plants - 112; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 3748 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:14400990..14403319 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 69152.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 637 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRDAIIADPL LAIDHETVAE KKKQSKNLKI SLLLLLILLA TSGYYSFSDN ITTVFLSRQA IDDDHSLSLG TISDVVESEN GVVAADDARC SEIGASVLRS 101: GGHAVDAAVA ITLCVGVVNP MSSGIGGGSF LIVSSQKDSK AEAFDMRETA PLAASKDMYK NDASAKSLGA LSMGVPGEIA GLYEAWKRYG RLPWKPLFEP 201: AIKLARDGFV VYPYLGKAIS TKVAMILKDP GMRSVFSRNG QVLKTGETCY NPELAQSLET ISEQGPGAFY NGTVGEKLVK DVKKAGGIIT MDDLRSYKVR 301: VTDAMSVDVM GYTVHGMPPP SGGTVGFSMV MNILDSYSNL YTASGRELGL HRLIEAMKHM FAARMDLGDP EFVNVTNSMN QMLSKAHAEE IQKRIFDNTT 401: FPPEYYMNRW SQLRDQGTSH FCVVDADRNS VSMTSTVNYR FGAGVLSPST GIVLNNEMDD FSTPTEITPD MLPPAPTNFI EPNKRPLSSM TPLVITKDGE 501: FVAALGGAGG MHIIPAVLQV FLNCFVLNMK PKEAVESARI YHRLIPNVVS YENFTTINGD HIGVSEDTKM FLAERGHELK ELSGGAIVQL IVQSFKEEKE 601: EEMIIEIGRK IGKKSKPLKG LLTAVSDPRK DGKPAAV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)