AT4G27520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : early nodulin-like protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
early nodulin-like protein 2 (ENODL2); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, copper ion binding; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plastocyanin-like (InterPro:IPR003245), Cupredoxin (InterPro:IPR008972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: early nodulin-like protein 1 (TAIR:AT5G53870.1); Has 168805 Blast hits to 80761 proteins in 2510 species: Archae - 213; Bacteria - 30974; Metazoa - 63826; Fungi - 28998; Plants - 14037; Viruses - 3902; Other Eukaryotes - 26855 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:13750668..13751819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35065.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 349 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTFLKMKSLS FFFTILLSLS TLFTISNARK FNVGGSGAWV TNPPENYESW SGKNRFLVHD TLYFSYAKGA DSVLEVNKAD YDACNTKNPI KRVDDGDSEI 101: SLDRYGPFYF ISGNEDNCKK GQKLNVVVIS ARIPSTAQSP HAAAPGSSTP GSMTPPGGAH SPKSSSPVSP TTSPPGSTTP PGGAHSPKSS SAVSPATSPP 201: GSMAPKSGSP VSPTTSPPAP PKSTSPVSPS SAPMTSPPAP MAPKSSSTIP PSSAPMTSPP GSMAPKSSSP VSNSPTVSPS LAPGGSTSSS PSDSPSGSAM 301: GPSGDGPSAA GDISTPAGAP GQKKSSANGM TVMSITTVLS LVLTIFLSA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)