AT4G22570.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.726 What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : adenine phosphoribosyl transferase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an adenine phosphoribosyltransferase (APT; EC 2.4.2.7), which is a constitutively expressed enzyme involved in the one-step salvage of adenine to AMP. APT3 has higher affinity for zeatin, isopentenyladenine and benzyladenine than APT1 but lower Vmax than APT1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
adenine phosphoribosyl transferase 3 (APT3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adenine phosphoribosyl transferase (InterPro:IPR005764), Phosphoribosyltransferase (InterPro:IPR000836); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: adenine phosphoribosyl transferase 4 (TAIR:AT4G12440.2); Has 8946 Blast hits to 8945 proteins in 2488 species: Archae - 280; Bacteria - 6058; Metazoa - 171; Fungi - 181; Plants - 166; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2090 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:11882310..11885250 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20353.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 183 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSGNKEEEDP RIHGIKTKIR VVPDFPKKGI MFQDITTVLL DPKAFKDTID LFVERYRDKN ISVVAGIEAR GFLFGPPIAL AIGAKFVPLR KPKKLPGETI 101: FEEYELEYGN DRLEMHIGAV EAGDRALVVD DLIATGGTLC AAINLLERVG AEVVECACVI ELPELKGRQR LKGKPLCMLV EYR |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)