AT1G80050.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : adenine phosphoribosyl transferase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an adenosine phosphoribosyl transferase(E.C:2.4.2.7), a constitutively expressed enzyme involved in the one-step salvage of adenine to AMP. This isozyme has high affinity for cytokinins and is likely to be localized to the cytosol. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
adenine phosphoribosyl transferase 2 (APT2); FUNCTIONS IN: phosphate transmembrane transporter activity, adenine phosphoribosyltransferase activity; INVOLVED IN: adenine salvage; LOCATED IN: cytosol, plasma membrane; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adenine phosphoribosyl transferase (InterPro:IPR005764), Phosphoribosyltransferase (InterPro:IPR000836); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: adenine phosphoribosyltransferase 5 (TAIR:AT5G11160.1); Has 8411 Blast hits to 8411 proteins in 2474 species: Archae - 199; Bacteria - 5670; Metazoa - 171; Fungi - 181; Plants - 165; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2025 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr1:-:30111708..30113261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 21009.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 5.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | 0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 192 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFAVENGLQG DPRLKAISDA IRVIPHFPKT GIMFQDITTL LLDPVAFKHV VDIFVDRYKH MNISLVAGVE ARGFIFGPPI ALAIGAKFVP LRKPGKLPGR 101: VISEEYELEY GRDCLEMSVE AVKSEERALI IDDLVATGGT LSASINLLER AGAEVVECAC VVGLPKFKGQ CKLKGKPLYV LVEPNQFDEL TL |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)