AT1G26100.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.741 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane protein family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane protein family; FUNCTIONS IN: carbon-monoxide oxygenase activity; LOCATED IN: endomembrane system, integral to membrane; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome b561, eukaryote (InterPro:IPR004877), Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane (InterPro:IPR006593); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome B561-1 (TAIR:AT5G38630.1); Has 590 Blast hits to 588 proteins in 96 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 373; Fungi - 7; Plants - 186; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 24 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:9022716..9024081 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26308.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 236 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSVDPSRLS LVLFARLSGL VVAVSVLYWA LFLPNLGLSY STLHPLLMVI GFILVSGEAI LIHRWLPGSR KTKKAVHLWL QGMALASAVF GIWTKFHYQR 101: GVFANFYSLH SWMGLLSVSL FAAQWVTGFM SFWHRGEVRT TRTTFLPWHV FLGLYTYGLA IATAETGLLE KLTFLQTKRN VPRRGSESMT VNGLGLGLAL 201: LGCIVITAAI LPKYQSHSRD EKLVYSSQDR PKCLSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)