AT4G21210.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PPDK regulatory protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a PPDK regulatory protein that has both protein kinase and protein phosphatase activities towards PPDK (pyruvate orthophosphate dikinase). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PPDK regulatory protein (RP1); FUNCTIONS IN: protein kinase activity, phosphoprotein phosphatase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyruvate Pi dikinase regulator (InterPro:IPR017409), Protein of unknown function DUF299, phosphotransferase, predicted (InterPro:IPR005177); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PPDK regulatory protein 2 (TAIR:AT3G01200.1); Has 4488 Blast hits to 4488 proteins in 1425 species: Archae - 0; Bacteria - 3133; Metazoa - 4; Fungi - 0; Plants - 63; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1288 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:11307002..11308587 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43686.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 403 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALLSAMKLQ GRPPPISSNL NPNSKPAGSD SVSLNASEPG SERKPRKFSS QLNRWNRART LRSGAKLDST ITNGSNNTTG PMRPIESSSR TDVSTLDSDV 101: SSSSNGVSEA DMTAAKSIYI VSDGTGWTAE HAVNAALGQF DYCLVDRGCP VNTHLFSGIE DGEKLMEIIK QAAREGAMVI YTLADPSMAE ATMRACKLWK 201: IPSLDILGPI TESISSHLGT NPSGLSRGIT NSSLNEDYFK RIEAIEFTIK HDDGALPENL EKADIVLVGV SRTGKTPLST YLAQKGYKVS NVPIVNGVDL 301: PKTLFEIDPR KVFGLMINPL VLQGIREARA KSLGLGSSFK TKYSELGSVK EELELAKKIF AENPTWPVIE VTESAIEETA AVVLRLYDER QSNRAMPRIS 401: KSY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)