AT4G04870.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cardiolipin synthase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with cardiolipin synthase activity that is localized to the mitochondiria. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cardiolipin synthase (CLS); FUNCTIONS IN: phosphatidyltransferase activity, cardiolipin synthase activity; INVOLVED IN: phospholipid biosynthetic process; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: CDP-alcohol phosphatidyltransferase (InterPro:IPR000462); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphatidylglycerolphosphate synthase 2 (TAIR:AT3G55030.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:2461904..2464004 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38044.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 341 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAIYRSLRKL VEINHRKTRP FFTAATASGG TVSLTPPQFS PLFPHFSHRL SPLSKWFVPL NGPLFLSSPP WKLLQSATPL HWRGNGSVLK KVEALNLRLD 101: RIRSRTRFPR QLGLQSVVPN ILTVDRNDSK EEDGGKLVKS FVNVPNMISM ARLVSGPVLW WMISNEMYSS AFLGLAVSGA SDWLDGYVAR RMKINSVVGS 201: YLDPLADKVL IGCVAVAMVQ KDLLHPGLVG IVLLRDVALV GGAVYLRALN LDWKWKTWSD FFNLDGSSPQ KVEPLFISKV NTVFQLTLVA GAILQPEFGN 301: PDTQTWITYL SWLVASTTMA STAAYGVQYW KKRPISMIKR S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)