AT4G05450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : mitochondrial ferredoxin 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
mitochondrial ferredoxin 1 (MFDX1); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, iron-sulfur cluster binding, 2 iron, 2 sulfur cluster binding; INVOLVED IN: pollen tube development; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ferredoxin (InterPro:IPR001041), Adrenodoxin (InterPro:IPR001055), Beta-grasp fold, ferredoxin-type (InterPro:IPR012675), Adrenodoxin, iron-sulphur binding site (InterPro:IPR018298); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MITOCHONDRIAL FERREDOXIN 2 (TAIR:AT4G21090.3); Has 4425 Blast hits to 4425 proteins in 1188 species: Archae - 2; Bacteria - 2167; Metazoa - 246; Fungi - 135; Plants - 85; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1790 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:2759048..2760634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21831.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 197 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIGHRISRLG STIVKQLARE GYLATYGTKN LHRSYGHYLQ SLPVVPRQAR TSQEAWFLKS HKFCTSSTTS SENGDEETEK ITIIFVDKDG EEIPVKVPIG 101: MSVLEAAHEN DIDLEGACEA SLACSTCHVI VMDTEYYNKL EEPTDEENDM LDLAFGLTET SRLGCQVIAR PELDGVRLAI PSATRNFAVD GFVPKPH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)