AT4G01690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Flavin containing amine oxidoreductase family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes protoporphyrinogen oxidase (PPOX). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PPOX; FUNCTIONS IN: oxygen-dependent protoporphyrinogen oxidase activity; INVOLVED IN: porphyrin biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Amine oxidase (InterPro:IPR002937), Protoporphyrinogen oxidase (InterPro:IPR004572); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Flavin containing amine oxidoreductase family (TAIR:AT5G14220.1); Has 2258 Blast hits to 2244 proteins in 787 species: Archae - 6; Bacteria - 1416; Metazoa - 200; Fungi - 137; Plants - 154; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 345 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:729929..732309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57698.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 537 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELSLLRPTT QSLLPSFSKP NLRLNVYKPL RLRCSVAGGP TVGSSKIEGG GGTTITTDCV IVGGGISGLC IAQALATKHP DAAPNLIVTE AKDRVGGNII 101: TREENGFLWE EGPNSFQPSD PMLTMVVDSG LKDDLVLGDP TAPRFVLWNG KLRPVPSKLT DLPFFDLMSI GGKIRAGFGA LGIRPSPPGR EESVEEFVRR 201: NLGDEVFERL IEPFCSGVYA GDPSKLSMKA AFGKVWKLEQ NGGSIIGGTF KAIQERKNAP KAERDPRLPK PQGQTVGSFR KGLRMLPEAI SARLGSKVKL 301: SWKLSGITKL ESGGYNLTYE TPDGLVSVQS KSVVMTVPSH VASGLLRPLS ESAANALSKL YYPPVAAVSI SYPKEAIRTE CLIDGELKGF GQLHPRTQGV 401: ETLGTIYSSS LFPNRAPPGR ILLLNYIGGS TNTGILSKSE GELVEAVDRD LRKMLIKPNS TDPLKLGVRV WPQAIPQFLV GHFDILDTAK SSLTSSGYEG 501: LFLGGNYVAG VALGRCVEGA YETAIEVNNF MSRYAYK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)