AT3G54090.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : fructokinase-like 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a fructokinase-like protein (AT3G54090/FLN1, AT1G69200/FLN2), a member of the pfkB-carbohydrate kinase family. FLN1 and FLN2 are potential plastidial thioredoxin z (TRX z) targets. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
fructokinase-like 1 (FLN1); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: acetate fermentation, sucrose biosynthetic process, sucrose catabolic process, using beta-fructofuranosidase; LOCATED IN: chloroplast nucleoid, nucleus, chloroplast, nucleoid, cytoplasm; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbohydrate/purine kinase (InterPro:IPR011611), Carbohydrate/puine kinase, PfkB, conserved site (InterPro:IPR002173); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fructokinase-like 2 (TAIR:AT1G69200.1); Has 4776 Blast hits to 4772 proteins in 1393 species: Archae - 92; Bacteria - 3898; Metazoa - 5; Fungi - 2; Plants - 280; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 499 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:20028145..20029835 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53784.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 471 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLLIFPHL HHFDSSLDRR EVLVVRHSQA SRRFLTPKAS INGSGITNGA AAETTSKPSR KGRKKKQTST VIEKDNTETD PELNPELADY DDGIEFPYDD 101: PPLVCCFGAV QKEFVPVVRV HDNPMHPDMY SQWKMLQWDP PEFGRAPGGP PSNVAISHVR LGGRAAFMGK VGEDDFGDEL VLMMNQERVQ TRAVKFDENS 201: KTACTRVKIK FKDGKMMAET VKEPPEDSLF ASELNLAVLK EARIFHFNSE VLTSPTMQST LFTAIQWSKK FGGLIFFDLN LPLPLWRSRN ETRKLIKKAW 301: NEANIIEVSQ QELEFLLDED YYERRRNYTP QYFAEDFDQT KNRRDYYHYT PEEIKSLWHD KLKLLVVTDG TLRLHYYTPT FDGVVIGTED VLITPFTCDR 401: TGSGDAVVAG IMRKLTTCPE MFEDQDVMER QLRFAVAAGI IAQWTIGAVR GFPTESATQN LKEQVYVPSM W |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)