AT3G52630.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.992 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleic acid-binding, OB-fold-like (InterPro:IPR016027), Replication factor A protein 3 (InterPro:IPR013970); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein (TAIR:AT4G18590.1); Has 94 Blast hits to 94 proteins in 37 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 29; Fungi - 0; Plants - 56; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19514184..19514596 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 11653.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 107 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDTSSPSAFV NGALLRRFIG QKVRTVIQVT GSEIGSVVGK STDDLQIVVR GSSPPSPLTT YLEVIGIAES DNAIRAETWT NFGNTFDTQN YNELCKLANG 101: EFKHLFI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)