AT3G49725.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GTP-binding protein, HflX | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
GTP-binding protein, HflX; FUNCTIONS IN: GTP binding; LOCATED IN: intracellular, chloroplast; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GTP1/OBG (InterPro:IPR006073), GTP-binding protein, HflX (InterPro:IPR016496), GTP-binding protein, HSR1-related (InterPro:IPR002917); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GTP-binding protein, HflX (TAIR:AT5G57960.1); Has 11258 Blast hits to 11241 proteins in 2608 species: Archae - 167; Bacteria - 7727; Metazoa - 332; Fungi - 38; Plants - 97; Viruses - 17; Other Eukaryotes - 2880 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:18442448..18445397 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 69583.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 620 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSVTTSFGIW LNHINLDNQA SFLYNNPHFC NRRFNRISML RTVSLARNRL RSETPSSFLA RDRLRSKTPS SSPFSSKRHT PKTSEIEEES TPKDSVLLNP 101: KDPSSAPKLF LVQPRLAPPK YLQAKLNEAL CLANSLEEQR YGYFESDFFD KELPSHVVVQ NPVRRSSKPR VDTYFGSGTV DNIKCHLNAE DSKEEVDAVF 201: VNAILTAIQQ RNLERIWAKP VLDRVGLIIE IFNAHAHTKE AKLQAELAAL MYNKSRLVRV RGTDGRHTFG QFGEAEVVSA RGRAGSKGTG GGFVGGAGET 301: ELQLQRRRIS DRRIRLLSQI KEAQRTRLLQ RAGRKKRVGL EGESSGTIAV VGYTNAGKST LISALTKTAL YCNERLFATL DPTLKSAHLP SGNFVLLSDT 401: VGFISDLPIQ LVKAFQSTLE EVVEADLLLH VVDSTAPNIE EHRSTVLHVL NQIGVPEEKL QNMIEVWNKI DYEEDEVEEE KYLDDGEGVG EEDEDEADLK 501: AEETVDASEA TVDEDQIQNG DGDDADGWLL SEDENADDPE FWKVPEVAKV DAANKKGPDV RVSALTGVGL KELLYLIDDK MKEKKLKSPT IVERSELHKR 601: KWRPPRNDDE EERLIPLDQR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)