AT3G49060.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.705 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : U-box domain-containing protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
U-box domain-containing protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: ubiquitin-protein ligase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, protein ubiquitination; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), U box domain (InterPro:IPR003613), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: U-box domain-containing protein kinase family protein (TAIR:AT2G45910.1); Has 84033 Blast hits to 83330 proteins in 4034 species: Archae - 70; Bacteria - 7751; Metazoa - 31165; Fungi - 5115; Plants - 29189; Viruses - 207; Other Eukaryotes - 10536 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:18187386..18191878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 91597.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 805 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGEIGGEELV LDVDETIFVA VAEDVERSKT TVLWAARNFS GKKICLLYVH RTARAASWTH KKLVGGSFKK HDVKVIERVE KPKVDELMNS YLQLLSETEI 101: QTDKLCIAGQ NIEECIVELI ARHKIKWLVM GAASDKHYSW KMTDLKSKKA IFVCKKAPDS CHIWFLCKGY LIFTRASNDD SNNRQTMPPL VQLDSDNETR 201: KSEKLESSYM RRRLRYWRSL LEQDGEKDTG QLEREKVEPR APPLFSSGSS SSFGEPVGPE PVSPELVDSD TLNTSNVEEK EREGDVARKV HRYDKAMHDI 301: GQSDRTVYGE AGKKWEEDAS TTEALCKAKA LEGLCIKESS QRKRLEELLE KEKLEVKMVI EQNNGFMKEL QMVQGRNLKL ESQMRKLQDL EKEHGEKFDT 401: AMELLKSFRQ KRDEIRIDHE NAVKEVNALR RLVKGETGES SGSEMLDYSF MEINEATNEF DPSWKLGEGK YGSVYKGNLQ HLQVAVKMLP SYGSLNHFEF 501: ERRVEILSRV RHPNLVTLMG ACPESRSLIY QYIPNGSLED CFSSENNVPA LSWESRIRIA SEICSALLFL HSNIPCIIHG NLKPSKILLD SNLVTKINDY 601: GISQLIPIDG LDKSDPHVDP HYFVSREMTL ESDIYAFGII LLQLLTRRPV SGILRDVKCA LENDNISAVL DNSAGDWPVA RGKKLANVAI RCCKKNPMNR 701: PDLAVVLRFI DRMKAPEVPS SETSSYANQN VPRRPPSHYL CPIFQEVMKD PLIAADGFTY EAEAIREWLA NGHDTSPMTN LKMEDCNLIP NHALHLAIQD 801: WQNQW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)