AT3G47060.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : FTSH protease 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes an FtsH protease that is localized to the chloroplast | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
FTSH protease 7 (ftsh7); FUNCTIONS IN: metallopeptidase activity, ATP-dependent peptidase activity, ATPase activity; INVOLVED IN: proteolysis, protein catabolic process; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M41, FtsH (InterPro:IPR005936), ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), ATPase, AAA-type, core (InterPro:IPR003959), ATPase, AAA-type, conserved site (InterPro:IPR003960), Peptidase M41 (InterPro:IPR000642), Peptidase M41, FtsH extracellular (InterPro:IPR011546); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FTSH protease 9 (TAIR:AT5G58870.1); Has 41243 Blast hits to 38738 proteins in 3322 species: Archae - 1531; Bacteria - 17472; Metazoa - 4873; Fungi - 3612; Plants - 3353; Viruses - 32; Other Eukaryotes - 10370 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:17332999..17336613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 87807.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 802 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTTTFEFLQP RIHGFATCCS SNSLLYSKAS RFFNDRCRVY RQNPNRFVSN SITLPLQKKQ VTVLRNHERF NLWDGFSRKK SRLVVNCQED DQNESSSEEE 101: ESSQSTPAKS ERKREKKEDK VWWSKGKKWQ WQPIIQAQGI GVLLLQLSVV MFVMRLLRPG IPLPGSEPRI QTTFVSVPYS EFLSKVNSNQ VQKVEVDGVQ 201: VLFKLRDDGK WQESETSRLS QSSESLLRTV APTKRVVYST TRPGDIKTPY EKMLGNNVEF GSPEKRSGGF FNSALIALFY IAVLAGLIRF PVSFSTSSTG 301: QLRTRKAGGP DGGKVSGGGE TITFADVAGV DEAKEELEEI VEFLRNPEKY VRLGARPPRG VLLVGLPGTG KTLLAKAVAG EAEVPFISCS ASEFVELYVG 401: MGASRVRDLF ARAKKEAPSI IFIDEIDAVA KSRDGKFRMG SNDEREQTLN QLLTEMDGFD SNSAVIVLGA TNRADVLDPA LRRPGRFDRV VTVETPDKIG 501: RESILRVHVS KKELPLGDDV NLGSIASMTT GFTGADLANL VNEAALLAGR KNKTNVEKID FIQAVERSIA GIEKKSARLK GNEKAVVARH EAGHAVVGTA 601: VANLLTGQPR VEKLSILPRT GGALGFTYIP PTSEDRYLLF IDELLGRLVT LLGGRAAEEV VYSGRISTGA FDDIRRATDM AYKAVAEYGL NQKIGPVSVA 701: TLSGGGIDDS GGSPWGRDQG KLVDLVQKEV TILLQSALDV ALSVVRANPD VLEGLGAQLE EKEKVEGEEL QKWLSMVVAP EELAVFVEGK QELLLPAQAS 801: SS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)