AT3G27230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF248, methyltransferase putative (InterPro:IPR004159); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT5G40830.2); Has 347 Blast hits to 346 proteins in 22 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 345; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:10054224..10055456 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45863.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 410 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSVSLKIGD GTARFRRTSI CSSAVNLLML FSVVTTNLFA LYAFSSHSQA NSPLLHSSNN ISLVSQHLSL ILREIDSSQR KLAQMEKQML GYESIDISRP 101: NIVPELKLFL QRHQLPLGKD SRTGITEMVS SVGHSCGKST DLLSQYMSYK VFDRCPDDWS LGQKLILRAC EPLPRRRCLA KTVQKQDLSK SPDSLWRSVS 201: NKSVNWSGLG CKSFDCLKGK KLSKECVGCF DLGVEKDRFV KVKGKNDFLI DDVLGLGSGK IRIGFDISGG SGTFAARMAE KNVTVITNTL NNGAPFSEFI 301: AARGLFPLFL SLDHRFPFLD NVFDLIHASS GLDVEGKAEK LEFLMFDLDR VLKPRGLFWL DNFYCANDEK KKELTRMIER FGYKKLKWVI GEKADAQVYL 401: SAVLQKPVRA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)