AT3G26980.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : membrane-anchored ubiquitin-fold protein 4 precursor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
membrane-anchored ubiquitin-fold protein 4 precursor (MUB4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Membrane-anchored ubiquitin-fold protein, HCG-1 (InterPro:IPR017000), Ubiquitin (InterPro:IPR000626), Ubiquitin supergroup (InterPro:IPR019955); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ubiquitin family protein (TAIR:AT4G24990.1); Has 168 Blast hits to 168 proteins in 26 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 11; Plants - 157; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:9946467..9947444 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 13452.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 120 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPEEDLVELK FRLYDGSDVG PFQYSPTATV SMLKERIVSE WPKDKKIVPK SASDIKLINA GKILENGKTV AQCKAPFDDL PKSVITMHVV VQLSPTKARP 101: EKKIEKEEAP QRSFCSCTIM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)