AT3G25585.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.649 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : aminoalcoholphosphotransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
aminoalcoholphosphotransferase (AAPT2) mRNA, complete cds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
aminoalcoholphosphotransferase (AAPT2); FUNCTIONS IN: phosphatidyltransferase activity, phosphotransferase activity, for other substituted phosphate groups; INVOLVED IN: phospholipid biosynthetic process; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Choline/ethanolaminephosphotransferase (InterPro:IPR014472), CDP-alcohol phosphatidyltransferase (InterPro:IPR000462); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: aminoalcoholphosphotransferase 1 (TAIR:AT1G13560.1); Has 933 Blast hits to 927 proteins in 242 species: Archae - 10; Bacteria - 37; Metazoa - 367; Fungi - 227; Plants - 82; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 210 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:9295856..9298271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43641.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 389 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGYIGAHGVA ALKKHKYSGV DHSYLAKYVL QPFWNRFVKI FPLWMPPNMI TLMGFMFLLT SALLGYIYSP KLDSPPPRWV HFAHGLLLFL YQTFDAVDGK 101: QARRTNSSSP LGELFDHGCD ALGCALETMA YGSTAMCGRD TFWFWVISAV PFFGATWEHY FTNTLTLPVV NGPTEGLALI YCGHFFTAIV GAEWWAQPFG 201: KSIPLFSWVP FLNEMQMSRI ILFSMIFFAV IPTLAINTSN VYKVVHSRNG SMLLALAMLY PLVTLIAGVL IWDYLSPIDL IRNYPHLVVL GTGLAFGFLV 301: GRMILAHLCD EPKGLKTNMC MSLLYLPFAL ANALTARLND GVPLVDEFWV LLGYCIFTLS LYAHFATSVI HEITTALGIY CFRITRKEA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)