AT3G25190.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Vacuolar iron transporter (VIT) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Vacuolar iron transporter (VIT) family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF125, transmembrane (InterPro:IPR008217); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Vacuolar iron transporter (VIT) family protein (TAIR:AT3G43660.1); Has 1809 Blast hits to 1804 proteins in 621 species: Archae - 86; Bacteria - 1207; Metazoa - 0; Fungi - 93; Plants - 206; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 217 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:9174505..9175614 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23212.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 219 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTSNVQLSET NSPRNQKTRP RAEKEEVDYM QRAQWLRAAL LGANDGLVTV ASLMMGVGSI KEDVKAMLLV GFAGLVAGAC SMAIGEFVSV CTQRDIETAQ 101: MKRAIEHKTS LSAIDEQEEE EKKERLPNPG QAAIASALAF SVGAAMPLLG AVFIENHKVR MVVVAVVATI ALVVFGVTGA VLGKTSVVKS SVRVVIGGWM 201: AMALTFGLTK FIGSAAMQI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)