AT3G24300.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ammonium transporter 1;3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a plasma membrane localized ammonium transporter. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ammonium transporter 1;3 (AMT1;3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ammonium transporter (InterPro:IPR001905), Ammonium transporter, conserved site (InterPro:IPR018047); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ammonium transporter 1;5 (TAIR:AT3G24290.1); Has 11505 Blast hits to 11486 proteins in 2067 species: Archae - 224; Bacteria - 4696; Metazoa - 434; Fungi - 433; Plants - 469; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5249 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:8805858..8807354 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53301.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 498 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSGAITCSAA DLATLLGPNA TAAADYICGQ LGTVNNKFTD AAFAIDNTYL LFSAYLVFAM QLGFAMLCAG SVRAKNTMNI MLTNVLDAAA GGLFYYLFGY 101: AFAFGGSSEG FIGRHNFALR DFPTPTADYS FFLYQWAFAI AAAGITSGSI AERTQFVAYL IYSSFLTGFV YPVVSHWFWS PDGWASPFRS ADDRLFSTGA 201: IDFAGSGVVH MVGGIAGLWG ALIEGPRRGR FEKGGRAIAL RGHSASLVVL GTFLLWFGWY GFNPGSFTKI LVPYNSGSNY GQWSGIGRTA VNTTLSGCTA 301: ALTTLFGKRL LSGHWNVTDV CNGLLGGFAA ITAGCSVVEP WAAIVCGFMA SVVLIGCNKL AELVQYDDPL EAAQLHGGCG AWGLIFVGLF AKEKYLNEVY 401: GATPGRPYGL FMGGGGKLLG AQLVQILVIV GWVSATMGTL FFILKRLNLL RISEQHEMQG MDMTRHGGFA YIYHDNDDES HRVDPGSPFP RSATPPRV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)