AT5G63600.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.992 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : flavonol synthase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a protein whose sequence is similar to flavonol synthase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
flavonol synthase 5 (FLS5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase (InterPro:IPR005123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: flavonol synthase 1 (TAIR:AT5G08640.2); Has 8358 Blast hits to 8322 proteins in 997 species: Archae - 0; Bacteria - 1127; Metazoa - 81; Fungi - 889; Plants - 4892; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1369 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:25461082..25462270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36965.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 325 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEEERDHNAS ESSLPSLSKQ LESSTLGGSA VDVPVVDLSV SDEDFLVREV VKASEEWGVF QVVNHGIPTE LMRQLQMVGT QFFELPDAEK ETVAKEEDFE 101: GYKKNYLGGI NNWDEHLFHR LSPPSIINYK YWPKNPPQYR EVTEEYTKHM KRLTEKILGW LSEGLGLQRE TFTQSIGGDT AEYVLRVNFY PPTQDTELVI 201: GAAAHSDMGA IALLIPNEVP GLQAFKDEQW LDLDYIDSAV VVIIGDQLMR MTNGRLKNVL HRAKSDKDKL RISWPVFVAP RADMSVGPLP EFTGDENPPK 301: FETLIYNDYI DQKIRGWALE DLPVY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)