AT2G46750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : D-arabinono-1,4-lactone oxidase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
D-arabinono-1,4-lactone oxidase family protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, D-arabinono-1,4-lactone oxidase activity, FAD binding, catalytic activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: hypocotyl, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: D-arabinono-1,4-lactone oxidase (InterPro:IPR007173), FAD-binding, type 2 (InterPro:IPR016166), Plant-specific FAD-dependent oxidoreductase (InterPro:IPR010030), FAD linked oxidase, N-terminal (InterPro:IPR006094); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: D-arabinono-1,4-lactone oxidase family protein (TAIR:AT2G46760.1); Has 2214 Blast hits to 2141 proteins in 703 species: Archae - 18; Bacteria - 1466; Metazoa - 84; Fungi - 192; Plants - 250; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 204 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:19208443..19210909 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64973.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 591 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAFTFPPSYR TLVGLYYIFT LMHTAVSTPP DDPVKCVSGN TNCTVTNSYG AFPDRSTCRA ANVAYPKTEA ELVSVVAAAT QAGRKMRVTT RYSHSITKLV 101: CTDGTEGLFI STKFLNHTVQ ADATAMTMTV ESGMTLRQLI VEAAKVGLAL PYAPYWWGLT VGGMMGTGAH GSSLWGKGSA VHDYVTEIRM VSPGSVNEGF 201: AKIRILSETT TPNEFNAAKV SLGVLGVISQ VTFELQPMFK RSLTYTMRND SDFEDQAVTF GKKHEFADFI WLPSQGKVVY RRDDRVAVNT SGNGLFDFLP 301: FRSQLSAAIA IIRTSEETQE RFRDANGKCV GATIISSTLF APSYGLTNNG IIFTGYPVVG SQNRMMSSGS CLDSLQDGLI TACAWDSRIK GEFFHQTTLS 401: VPLTQVKSFI SDIKSLVKIE QKSLCGLELH YGILMRYVTS SPAYLGKETE ALDFDITYYR AKDPLTPRLY EDFIEEIEQI ALFKYNALPH WGKNRNLAFD 501: GVIRKYNNAP AFLKVKDSYD PKGLFSSEWT DQILGIKGNA SIVKDGCALE GLCICSKDAH CAPAKGYLCR PGKVYKEARV CTRVDGIISV I |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)